Phân loại liên bộ Cá đuối hiện tại đang được tích cực sửa đổi. Fishes of the World của Nelson năm 2006 công nhận 4 bộ. Nhóm Sclerorhynchoidea thuộc đại Trung sinh là cơ sở hoặc incertae sedis; chúng thể hiện các đặc trưng của bộ Rajiformes nhưng có mõm tương tự như của cá đao.

Bộ Torpediniformes

Cá đuối điện có các cơ quan phát ra điện trong các tấm vây ức. Các cơ quan này được sử dụng để phóng ra tia điện nhằm làm tê liệt con mồi và để phòng ngự. Dòng điện này đủ mạnh để làm con người bất tỉnh, và những người Hy Lạp cùng La Mã cổ đại sử dụng các loài cá này để điều trị chứng đau đầu.[8]

• Họ Narcinidae
• Họ Narkidae (có thể gộp trong họ Narcinidae)
• Họ Hypnidae (có thể gộp trong họ Torpedinidae)
• Họ Torpedinidae (Họ Cá đuối điện)

Bộ Pristiformes

Cá đao trông giống như cá mập, có đuôi để bơi và các vây ức nhỏ hơn so với phần lớn các loài cá đuối khác. Các vây ức của chúng gắn với phần trên của mang như ở mọi loài cá đuối khác, làm cho chúng có bề ngoài với đầu rộng. Chúng có mõm dài, phẳng với một hàng các tấm răng ở cả hai hàm. Mõm chúng dài tới 1,8 mét (6 ft), và rộng 30 cm (1 ft), được dùng để chém và xiên qua các con cá nhỏ cũng như để thăm dò trong bùn nhằm tìm kiếm các sinh vật ẩn nấp trong đó. Cá đao có thể tiến vào các sông và hồ nước ngọt. Một vài loài dài tới 6 mét (20 ft).

• Họ Pristidae (Họ Cá đao (cá sụn))

Bộ Rajiformes

• Họ Anacanthobatidae
• Họ Arhynchobatidae
• Họ Rajidae (Họ Cá đuối thường)
• Họ Rhinobatidae (Họ Cá đuối dài)
• Họ Rhinidae (Họ Cá giống, có thể gộp trong họ Rhinobatidae)
• Họ Rhynchobatidae (Họ Cá đuối lưỡi cày, có thể gộp trong họ Rhinobatidae)

Bộ Myliobatiformes

• Họ Dasyatidae (Họ Cá đuối bông)
• Họ Gymnuridae (Họ Cá đuối bướm)
• Họ Hexatrygonidae (Họ Cá đuối sáu mang)
• Họ Myliobatidae (họ Cá đuối ó)
• Họ Plesiobatidae (Họ Cá đuối biển sâu)
• Họ Potamotrygonidae (Họ Cá đuối sông)
• Họ Urolophidae (Họ Cá đuối tròn)
• Họ Urotrygonidae (Họ Cá đuối tròn Mỹ)
• Họ Platyrhinidae (Họ Cá đuối đĩa, có thể thuộc Rajiformes và gộp trong Rhinobatidae)
• Họ Zanobatidae (Họ Cá đuối quạt, có thể thuộc Rajiformes và gộp trong Rhinobatidae)